故事的主角陳博士，有著一段慘不忍睹的童年經歷，他親眼看到一個神秘的閃電球從窗外飄了進來，將他的父母燒成了灰燼。長大后，陳博士愛上了物理學，因為他想知道到底是什么力量造成了父母的慘劇。后來，陳博士到泰山參與了一個閃電研究項目，認識了一個叫林云的軍人，林云給陳博士留下了深刻的印象。但是，陳博士發現林云研究球狀閃電是想把它當成戰爭武器攻擊敵軍的航母或者坦克，這可是目睹雙親被閃電燒成灰燼的他不愿意接受的。可是陳博士最終還是順從了林云。為了推導出球狀閃電的數學模型，林云入侵了一個外國網站，后來被人家發現了并留言讓她到俄羅斯的某個地方。當他們到達當地的球狀閃電研究基地后，得知這里成功觸發了27個球狀閃電并電死了工程師的兒子。　　 陳博士特別同情工程師，決定放棄研究球狀閃電，于是和林云分道揚鑣了。不久之后，珠峰號航空母艦的艦長江星辰找到了陳博士，讓他阻止林云。陳博士被迫加入了球狀閃電的研究基地，后來因為自己研究的球狀閃電擊殺了幾十個被劫持的小學生，陳博士陷入了自責，最后離開了研究所。不久，戰爭爆發了，林云的球狀閃電投入戰場卻沒有殺死敵人。萬念俱灰的林云強行開啟宏原子核聚變實驗，研究出威力更大的武器，她用生命結束了戰爭，令全世界為宏聚變武器的威力震驚，她自己也化成了量子態，向父親吐露出內心的秘密。最終，陳博士和大學同學戴琳結了婚，可他的房間里面永遠擺放著一個空花瓶，那里面是林云曾經為他插上的量子玫瑰。